Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms