Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms