Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRGP23470 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRGP23470 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
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