Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms