Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms