Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT1P21579 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT1P21579 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms