Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms