Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF3P18847 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF3P18847 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF3P18847 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms