Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCG2P13521 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG2P13521 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms