Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI2P10070 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI2P10070 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI2P10070 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI2P10070 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI2P10070 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GLI2P10070 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI2P10070 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI2P10070 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI2P10070 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI2P10070 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI2P10070 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI2P10070 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI2P10070 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms