Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms