Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms