Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGA3P0DJD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms