Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms