Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIL1P09327 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIL1P09327 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIL1P09327 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIL1P09327 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms