Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms