Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOAP06340 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms