Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYCNP04198 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCNP04198 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCNP04198 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCNP04198 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCNP04198 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms