Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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