Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf47O95873 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms