Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE8BO95263 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE8BO95263 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms