Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP19O94966 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP19O94966 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP19O94966 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP19O94966 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP19O94966 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP19O94966 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP19O94966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP19O94966 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms