Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRMUO75648 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms