Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms