Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF3O75054 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms