Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATCO43716 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATCO43716 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATCO43716 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATCO43716 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms