Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRC1O43663 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRC1O43663 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRC1O43663 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms