Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM6AO15550 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM6AO15550 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms