Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms