Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1D1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1D1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1D1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1D1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1D1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms