Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CROCC2H7BZ55 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CROCC2H7BZ55 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms