Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms