Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms