Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM200CA6NKL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM200CA6NKL6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms