Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms