Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms