Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBA6A0AVT1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms