Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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