Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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