Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms