Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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VPS72Q15906 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VPS72Q15906 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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