Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CUL3Q13618 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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