Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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FOXC1Q12948 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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