Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms