Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CIPCQ9C0C6 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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