Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms