Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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