Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARS2-201ENST00000282276 3019 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL11A-202ENST00000356842 3959 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA5-205ENST00000554276 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHM3-204ENST00000457206 3689 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBA7-201ENST00000333486 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANGPT4-201ENST00000381922 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGSF11-203ENST00000425327 3525 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIF3A-205ENST00000377670 5852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CECR2-201ENST00000262608 4783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPY2R-201ENST00000329476 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR3B-201ENST00000228347 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD274-201ENST00000381573 3343 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2CD5-201ENST00000333957 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL32-204ENST00000536676 3699 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAL-201ENST00000261208 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2S2-201ENST00000341959 1047 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms