Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms