Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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